El fondo cuenta con la documentación producida por el intelectual argentino durante sus misiones y funciones profesionales. Las mismas abarcan desde la investigación del mundo griego hasta la docencia universitaria, pasando por su labor referida a la indagación de las relaciones entre religión y política del Movimiento de Sacerdotes para el Tercer Mundo (MSTM), que reconstruye el marco general de la época comprendida entre mediados de la década del ‘60 y ‘70. Aporta una mirada de conjunto de la naturaleza social y política en el clero, el marxismo y las discusiones internas sobre el peronismo.
Se trata en mayor medida de carpetas dentro de las cuales aparecen indistintamente documentos de variados tipos, con información relacionada entre sí. Algunos están mecanografiados y los del último período redactados e impresos desde computadora. Muchos cuentan con copias en diversas etapas de redacción o con correcciones manuscritas. Es notoria la prolijidad de sus notas y borradores (escritos en lápiz negro o bolígrafo), los que son legibles y casi sin tachaduras. En cambio, los textos impresos (bibliografía consultada o de su propia autoría), si muestran correcciones, tachones y agregados (muchas veces en fibra o marcador). También aparecen agrupaciones de textos de congresos y eventos de carácter cultural en los que participó como expositor, organizador o presidente de mesa, planes de estudio de su etapa como docente universitario, borradores de traducciones, bocetos para revistas en las que colaboró, publicaciones que compiló, bibliografía sobre los temas que estudió, colecciones bibliográficas y hemerográficas, literatura griega y ejemplares de sus obras publicadas. Además, correspondencia y datos compilados para reportajes, se suman a fotografías, libretas de informantes, reportes, dibujos y fichas que relacionan la documentación acopiada para cada investigación.

La documentación correspondiente a esta Serie documental, está compuesta por diversidad de borradores de textos manuscritos e impresos, recortes de diarios y revistas (algunos, de épocas previas a las propias entrevistas), conservados en carpetas, sobres de correspondencia e incluso envoltorios de resmas de papel, como el que ilustra este registro (donde se lee: “ENTREVISTA MSTM”). La misma sigla, se observaba en las cajas recibidas como donación y hacen referencia al Movimiento de Sacerdotes para el Tercer Mundo. Se trata de las únicas rotuladas, destacando el interés sobre el particular. En ellas, se pueden encontrar los profusos documentos acumulados en la tarea de escritura de los libros y artículos de José Pablo Martín, así como los detalles su forma de trabajo. Estas charlas transcriptas no eran grabadas, sino que tomaba notas a mano y luego solicitaba a los entrevistados que corrigieran y aprobaran sus textos (algunos le mencionan con sorpresa, que fueran de tal exactitud). El propio productor explica esta metodología en el inicio de las entrevistas o prólogos de sus libros: “El Movimiento de Sacerdotes para el Tercer Mundo. Un debate argentino”, de 1992, reeditado por la Universidad Nacional de General Sarmiento en 2010, y “Ruptura ideológica del catolicismo argentino”, de la Colección Humanidades, de la Editorial Universidad Nacional de General Sarmiento, en 2013. También cómo cambió su comodidad de trabajo en el viejo mundo, cuando recién llegado a la Argentina en 1970, recibió de varias personas (entre ellos los obispos Angelelli y Bonamin), la idea de trabajar en el país sobre los curas que retomaban la idea del primer cristianismo que él había estudiado en Europa. Como tuvo que sortear durante 20 años de trabajo (17 de entrevistas) las complicaciones que le deparó la ardua empresa emprendida debido a la coyuntura. Queda expuesto además que la invitación de la Fundación Humboldt y sus tareas de investigación en el CONICET, le permitieron “utilizar las cómodas bibliotecas alemanas” y hacer un trabajo paralelo sobre la antigüedad y la historia argentina contemporánea.
Otros autores lo citan en sus propias investigaciones posteriores (lo que hace honor a su deseo de que sus textos sean un puntapié inicial para que “tomen la posta” los jóvenes), como es el caso de: "Profeta del Genocidio" (de Lucas Bilbao y Ariel Lede Mendoza, Editorial Sudamericana). En el libro, el propio José Pablo explica el contexto del tema tratado y su relación personal con alguien que veía con malos ojos al MSTM, aunque colaboró brindando su opinión y datos para la realización del trabajo.